负责全院日常运转和综合协调；承担文电、宣传、机要、保密、档案、后勤服务和干部人事等工作。主要负责人：蒋钦群。

监察室主要职责
1、检查本单位干部职工在遵守、执行法律、法规和上级决定、命令中的问题。
2、协助院领导抓好院机关及所属单位的廉政勤政建设和反腐败工作，督促、协调本单位研究、制订本单位综合治理腐败的有效措施。
3、受理对本单位干部职工违反行政纪律行为的控告、检举，调查处理其违反行政纪律的行为。
4、受理本单位职工不服行政主管机关给予行政处分决定的申诉，以及管辖范围内法律、行政法规规定的其他由监察机关受理的申诉。
5、监督检查本单位及所属单位工作人员廉政勤政状况；负责本单位及所属单位监察干部的业务培训工作。
6、完成所在地政府监察局和本单位行政领导交办的其他工作。

负责全院财务预决算编制与组织实施；负责全院财务会计、国有资产管理与监督、对外投资管理、政府采购管理工作；对全院会计从业人员进行业务指导。主要负责人：张亚杰。

科研室职责：
 
1、负责编制下达年度科研计划，组织科研项目实施加强项目的督查、考评和验收，确保各类科研项目顺利实施。
2、负责科研项目的储备和申报工作。
3、组织申报各类科研成果。
4、组织全员科技人员撰写论文、论著。
5、负责科研档案管理工工作，重点做好科技档案、种质资源的登记保管工作。
6、及时搜集国内外最新农业科技资料，把握科研动态，做好学科建设规划与管理。
7、负责实施科技特派员行动计划，组织好科技下乡、科技培训、科技服务工作。

        韭菜研究室主要从事韭菜种质资源、育种、栽培、生理生化等技术研究，为农业增收、农民增效服务。于1976年开始韭菜育种研究，1981年育成了我国第一个人工培育的韭菜新品种791；1981年在全国首次发现韭菜雄性不育株，经过转育、筛选、培育出优良的韭菜雄性不育系和自交系，1993年育成了我国第一个韭菜一代杂交种---赛松。“平丰”牌韭菜种子，2004年获得“河南名牌产品”称号，是河南省唯一一个蔬菜种子名牌产品，平丰系列、平韭系列韭菜新品种覆盖率占全国韭菜栽培总面积的70%以上，并出口日本、俄罗斯，美国、韩国和意大利等国家，在国内外具有较高的知名度。
    38年以来，先后培育出791、豫韭菜1号、豫韭菜2号、平韭4号、平丰1号、平丰6号、平丰8号、平丰9号、平韭杂2、赛松、韭宝、绿宝和平丰薹韭王等13个韭菜新品种，累计示范推广500多万亩，创社会经济效益30亿元以上。获得市级以上成果23项。其中，国家级成果奖2项，省部级成果奖7项。在省以上科技刊物上发表有关韭菜研究论文99篇，出版韭菜方面的著作8部。
    现有工作人员12名。其中，享受国务院特殊津贴专家1名、研究员1名、副研究员5名、助理研究员3名；硕士生3名、本科生6名、高级技术工作3名。

        平顶山市农业生物技术重点实验室是平顶山市农科院内设业务科室。实验室下设植物组培及分子育种研究室、农产品加工研究室和花卉研究室。现有人员14名，其中博士1人，硕士3人，副研究员2人，助理研究员5人。主要开展生物育种、基因工程、细胞工程、天然产物提取、高档名优花卉温室周年生产、主要农业病虫害的诊断识别防治、土壤养分速测和配方施肥等工作。
        实验室成立以来，先后开展了甘薯、马铃薯茎尖脱毒快繁，袋鼠花、非洲紫罗兰、大花惠兰、红掌、蝴蝶兰、凤梨等花卉组培快繁；蝴蝶兰、凤梨花周年生产技术研究；韭菜DNA指纹谱图构建及杂种优势利用研究；韭籽、芦笋、辛夷等植物的生物活性物质提取及功能性产品研发技术研究；韭菜单倍体培养技术研究；韭菜分子标记辅助育种技术研究等项目，并取得阶段性成果。曾承担市级以上的重大科技攻关项目4项，获市级以上奖励4项，在大学学报及核心期刊发表论文40多篇。

       粮作研究室主要从事小麦、玉米、大豆等农作物新品种选育、农业新技术研究、示范和推广工作。现有科研人员15人，其中高中级专业技术人员7人，试验地70余亩，并且拥有较完备的试验设施和种子检验设备。

        中心成立以来，一直致力小麦、玉米、大豆、红薯等农作物新品种的引进试验与推广工作。先后承担省、市科研项目26项，获市级科技成果特等奖1项，一等科技成果奖5项，二等科技成果奖8项，省级三等以上科技成果奖3项。培育出小麦新品种2个：平麦998、平麦02-16，玉米新品种1个：平玉8号，大豆新品种2个：平豆1号、平豆2号，红薯新品种2个：豫薯9号、平薯3号。先后引进省内外名、特、新、优农作物新品种200多个，筛选出适合平顶山市生产上利用的新优品种20多个，为平顶山市农业生产和农村经济发展做出了积极贡献。在省级以上报刊发表论文20余篇，主要参编论著3部：《黄淮南片小麦主要审定推广品种及其选育》、《现代河南大豆品种栽培技术》由中国农业科技出版社出版；《河南省小麦新品种研究》由中国广播电视出版社出版。

        目前，承担有河南省小麦新品种预试、区试和生产试验，河南省玉米新品种预试、区试和生产试验。承担国家成果转化项目1项、省级成果转化项目3项，省重大科技攻关1项、省星火计划1项，市级科技攻关6项。

       果菜研究室主要开展林果、蔬菜、瓜类等种质创新、新品种选育及病虫害防治等研究工作；开展轻简化、绿色化栽培模式的创新应用、设施农业新技术等研究工作，承担林果、蔬菜、瓜类新品种、新技术引进、示范推广与技术服务工作。主要负责人：王贞、周威。

循环农业研究室主要开展畜禽和食用菌种质资源保护利用、新品种选育、病害防治诊断、健康种养、饲草菌料、生态循环等技术研究工作；承担畜禽和食用菌新品种、新技术引进、示范推广与技术服务工作。主要负责人：李俊朋。

负责全院土地管理、土地利用规划、基地建设、公共设施管理及相应的服务保障等工作。主要负责人：鲁自芳。

       根据河南省人力资源和社会保障厅〔2011〕第14号文件精神，平顶山市农业科学院被河南省人力资源和社会保障厅批准为河南省第二批博士后研发基地（目前平顶山市有5家省博士后研发基地，市农业科学院是唯一一家农业类博士后研发基地）。

博士后研发基地建设的主要目标和研发方向

    主要目标：3-5年内引进博士等高层次科研人才8-10人，把研发基地建成以韭菜研究为龙头，农、林、牧、菜多学科协调发展、国内学科领先的创新型科技团队。组织实施国家、省、市重大农业科技项目3-5项，完成并获得省以上科技成果奖2-3项。培育具有重大应用前景和自主知识产权的突破性优良新品种2-3个，通过示范推广创造显著的社会经济效益。
    主要研发方向：一是开展韭菜育种研究。保持平顶山市农业科学院在韭菜研究领域内的领先地位。主要开展韭菜多基因聚合育种技术研究，选育抗虫韭菜新品种。二是开展主要农作物育种研究，提高粮食生产能力。开展小麦、玉米等主要农作物新品种选育，为粮食生产提供优质高产新品种。三是开展农产品加工研究，提高农业附加值和经济效益。主要开展：韭籽生物活性物质提取及加工工艺研究；优质蔬菜深加工技术研究。研发出韭籽加工产品2-3个、蔬菜深加工产品2-3个。
    目前工作进展：市政府46次常务会议会专题研究了我院关于“省博士后研发基地建设”的请示，同意引进博士等高层次专业技术人才8—10人到博士后研发基地工作，人员编制报市编办审定；博士后研发基地专项经费按每人5万元纳入财政预算，据实解决；为解决博士后等高层次人才安居问题，同意筹建博士公寓1栋。依托“河南省博士后研发基地”，“韭籽深加工技术研究及产业化”项目与河南省农业科学院顺利对接，引进博士3名，该项目已列入省博管办2012年第一批研发合作项目，按计划正常开展。

“南繁育种试验站”是平顶山市委2012年一号文件重点支持的建设项目。院党委高度重视，成立了南繁育种试验站建设领导小组，多次召开专题会议安排部署，研究制定实施方案。2012年12月，先后3次选派人员到海南省乐东县调研、考察、选址，最后确定在海南省乐东黎族自治县九所镇租地20亩，租期30年；建粮食作物南繁育种实验区1个、蔬菜瓜果南繁育种实验区1个；建办公生活用房1栋，打机井1眼，安装了试验地喷灌系统，完成了水电安装、围墙、晒场等辅助配套设施建设，现已投入使用。